プロテオームの持つ多様性とダイナミックレンジにより、探索機能と定量機能のいずれかを犠牲にすることなく、両方を最大化する必要が生じています。
ライフサイエンス研究において、「ショットガン」またはボトムアッププロテオミクス(タンデム LC-MS/MS)は、タンパク質とその変化(翻訳後修飾(PTM)を含む)を包括的に分析し、生物システムの全体的な解釈を行うために使用される重要な方法です。一般に、タンデム質量スペクトルを生成するには、主に 2 つのアプローチがあります。どちらも SCIEX ソリューションでサポートされており、データ依存型取得 (DDA情報依存型取得(IDA) とも呼ばれます) と SWATH データ非依存型取得 (DIA) があります。