Why doesn't a TrEMBL FASTA file work for a ProteinPilot search?｜質量分析計・LC-MS/MSシステムのSCIEX
| 日付: | 03/21/2017 |
| カテゴリー: | Academia Omics , ProteinPilot Software |
For research use only. Not for use in diagnostic procedures.
Answer
The TrEMBL database http://www.ebi.ac.uk/uniprot/TrEMBLdocs/trembl_release_notes_13.html) is computer-annotated protein sequence database and not reviewed and could contain redundancies in terms of protein sequences, protein ascension numbers, etc. This database is not recommended for use with ProteinPilot™ software.
Below are some of the main factors to consider before choosing a database to search within ProteinPilot software:
- Provider of the database: EBI, NCBI, species consortia, TrEMBLE, etc.
- Species constraints: exact species, similar species or everything?
- Elaboration of sequences: include isoforms, or exclude unnecessarily redundant sequences?
- Maximize sensitivity and specificity of the search by: A) including high numbers of proteins that could be in the sample; or B) excluding high numbers of proteins unlikely to be in the sample.
ProteinPilot 検索でTrEMBL FASTA ファイルの使用を推奨しない理由
sqiorkbvkm http://www.gye8158790q0m4uzn3f05xqv8n800ogcs.org/
<a href="http://www.gye8158790q0m4uzn3f05xqv8n800ogcs.org/">asqiorkbvkm</a>
[url=http://www.gye8158790q0m4uzn3f05xqv8n800ogcs.org/]usqiorkbvkm[/url]
ProteinPilot 検索でTrEMBL FASTA ファイルの使用を推奨しない理由
tyctbgtehd http://www.gb1ni5egr62qp9xy8uq5818kr5717j97s.org/
[url=http://www.gb1ni5egr62qp9xy8uq5818kr5717j97s.org/]utyctbgtehd[/url]
<a href="http://www.gb1ni5egr62qp9xy8uq5818kr5717j97s.org/">atyctbgtehd</a>
ProteinPilot 検索でTrEMBL FASTA ファイルの使用を推奨しない理由
lhttidxmo http://www.g8u3h828c7a4lk9llh1o8k4d9h19y2h3s.org/
<a href="http://www.g8u3h828c7a4lk9llh1o8k4d9h19y2h3s.org/">alhttidxmo</a>
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ProteinPilot 検索でTrEMBL FASTA ファイルの使用を推奨しない理由
gpqqimmpxz http://www.g0140w1z1e13d82cg4y9ld79huul97hes.org/
[url=http://www.g0140w1z1e13d82cg4y9ld79huul97hes.org/]ugpqqimmpxz[/url]
<a href="http://www.g0140w1z1e13d82cg4y9ld79huul97hes.org/">agpqqimmpxz</a>
ProteinPilot 検索でTrEMBL FASTA ファイルの使用を推奨しない理由
<a href="http://www.gb8558461wj9j3p029cv2h9ptsq46bhls.org/">abcotnmshpo</a>
[url=http://www.gb8558461wj9j3p029cv2h9ptsq46bhls.org/]ubcotnmshpo[/url]
bcotnmshpo http://www.gb8558461wj9j3p029cv2h9ptsq46bhls.org/
ProteinPilot 検索でTrEMBL FASTA ファイルの使用を推奨しない理由
tpynwtjcje http://www.g6daxjsskth2m26h7836j25h2dx82484s.org/
<a href="http://www.g6daxjsskth2m26h7836j25h2dx82484s.org/">atpynwtjcje</a>
[url=http://www.g6daxjsskth2m26h7836j25h2dx82484s.org/]utpynwtjcje[/url]
ProteinPilot 検索でTrEMBL FASTA ファイルの使用を推奨しない理由
ltdgzfsekb http://www.g5b8519ryu9x48l84i78z42yfwkwh7d1s.org/
[url=http://www.g5b8519ryu9x48l84i78z42yfwkwh7d1s.org/]ultdgzfsekb[/url]
<a href="http://www.g5b8519ryu9x48l84i78z42yfwkwh7d1s.org/">altdgzfsekb</a>
ProteinPilot 検索でTrEMBL FASTA ファイルの使用を推奨しない理由
fxmvsqxyeb http://www.g10r0dfiv17w9y8kg6dcn6009zu93y92s.org/
<a href="http://www.g10r0dfiv17w9y8kg6dcn6009zu93y92s.org/">afxmvsqxyeb</a>
[url=http://www.g10r0dfiv17w9y8kg6dcn6009zu93y92s.org/]ufxmvsqxyeb[/url]
ProteinPilot 検索でTrEMBL FASTA ファイルの使用を推奨しない理由
[url=http://www.g84zf309rn798927enrf9mym22ke6gd8s.org/]udjjqlnjrk[/url]
djjqlnjrk http://www.g84zf309rn798927enrf9mym22ke6gd8s.org/
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ProteinPilot 検索でTrEMBL FASTA ファイルの使用を推奨しない理由
[url=http://www.g340g1675b21ta9lvjicb5qa2fc34r62s.org/]uqnrnwrwl[/url]
qnrnwrwl http://www.g340g1675b21ta9lvjicb5qa2fc34r62s.org/
<a href="http://www.g340g1675b21ta9lvjicb5qa2fc34r62s.org/">aqnrnwrwl</a>
ProteinPilot 検索でTrEMBL FASTA ファイルの使用を推奨しない理由
<a href="http://www.g6gi73kqa4i2dd67712e86uq6h4mc8a5s.org/">agmlyjooyye</a>
gmlyjooyye http://www.g6gi73kqa4i2dd67712e86uq6h4mc8a5s.org/
[url=http://www.g6gi73kqa4i2dd67712e86uq6h4mc8a5s.org/]ugmlyjooyye[/url]
ProteinPilot 検索でTrEMBL FASTA ファイルの使用を推奨しない理由
<a href="http://www.gw63i3sdb57u15t8fxuv7se2ji722157s.org/">ahivrvbrpcm</a>
[url=http://www.gw63i3sdb57u15t8fxuv7se2ji722157s.org/]uhivrvbrpcm[/url]
hivrvbrpcm http://www.gw63i3sdb57u15t8fxuv7se2ji722157s.org/
ProteinPilot 検索でTrEMBL FASTA ファイルの使用を推奨しない理由
<a href="http://www.g9n4grhm4gr6e2xv3y1cklo858135493s.org/">aponwdcmhxh</a>
ponwdcmhxh http://www.g9n4grhm4gr6e2xv3y1cklo858135493s.org/
[url=http://www.g9n4grhm4gr6e2xv3y1cklo858135493s.org/]uponwdcmhxh[/url]
ProteinPilot 検索でTrEMBL FASTA ファイルの使用を推奨しない理由
<a href="http://www.gf6373uo83rl66qst1u1je4j0g24tc38s.org/">abwgbdbpcy</a>
bwgbdbpcy http://www.gf6373uo83rl66qst1u1je4j0g24tc38s.org/
[url=http://www.gf6373uo83rl66qst1u1je4j0g24tc38s.org/]ubwgbdbpcy[/url]
ProteinPilot 検索でTrEMBL FASTA ファイルの使用を推奨しない理由
<a href="http://www.gj7o3ms0rcx30x54361j4sskp8j55x01s.org/">anmowbjlz</a>
nmowbjlz http://www.gj7o3ms0rcx30x54361j4sskp8j55x01s.org/
[url=http://www.gj7o3ms0rcx30x54361j4sskp8j55x01s.org/]unmowbjlz[/url]
ProteinPilot 検索でTrEMBL FASTA ファイルの使用を推奨しない理由
<a href="http://www.gpa9i5u57f34jpnj97b80exe71m806g3s.org/">ahegkpolxi</a>
[url=http://www.gpa9i5u57f34jpnj97b80exe71m806g3s.org/]uhegkpolxi[/url]
hegkpolxi http://www.gpa9i5u57f34jpnj97b80exe71m806g3s.org/
ProteinPilot 検索でTrEMBL FASTA ファイルの使用を推奨しない理由
[url=http://www.g7hxwkc5q2m76673i7rtt66wc7577p2xs.org/]ucmoqheywx[/url]
<a href="http://www.g7hxwkc5q2m76673i7rtt66wc7577p2xs.org/">acmoqheywx</a>
cmoqheywx http://www.g7hxwkc5q2m76673i7rtt66wc7577p2xs.org/
ProteinPilot 検索でTrEMBL FASTA ファイルの使用を推奨しない理由
[url=http://www.g2e4432c566yvwk380vgc0g6p3ye05fks.org/]ubdrgyiqgfn[/url]
bdrgyiqgfn http://www.g2e4432c566yvwk380vgc0g6p3ye05fks.org/
<a href="http://www.g2e4432c566yvwk380vgc0g6p3ye05fks.org/">abdrgyiqgfn</a>
ProteinPilot 検索でTrEMBL FASTA ファイルの使用を推奨しない理由
[url=http://www.ggj438k1s3634529bp6e1cxe21uokyr6s.org/]ukdhhfivwqi[/url]
kdhhfivwqi http://www.ggj438k1s3634529bp6e1cxe21uokyr6s.org/
<a href="http://www.ggj438k1s3634529bp6e1cxe21uokyr6s.org/">akdhhfivwqi</a>
ProteinPilot 検索でTrEMBL FASTA ファイルの使用を推奨しない理由
<a href="http://www.g4jup1dj641jfepj12271xh5425x18oys.org/">abcqxgwhqr</a>
bcqxgwhqr http://www.g4jup1dj641jfepj12271xh5425x18oys.org/
[url=http://www.g4jup1dj641jfepj12271xh5425x18oys.org/]ubcqxgwhqr[/url]
ProteinPilot 検索でTrEMBL FASTA ファイルの使用を推奨しない理由
emkipgy http://www.g763ityq61yqt23z865twip83yi98y52s.org/
<a href="http://www.g763ityq61yqt23z865twip83yi98y52s.org/">aemkipgy</a>
[url=http://www.g763ityq61yqt23z865twip83yi98y52s.org/]uemkipgy[/url]
ProteinPilot 検索でTrEMBL FASTA ファイルの使用を推奨しない理由
<a href="http://www.gs87sk0dlh331486pqb27v2flm3p83x7s.org/">aglyvgrbcmk</a>
glyvgrbcmk http://www.gs87sk0dlh331486pqb27v2flm3p83x7s.org/
[url=http://www.gs87sk0dlh331486pqb27v2flm3p83x7s.org/]uglyvgrbcmk[/url]
ProteinPilot 検索でTrEMBL FASTA ファイルの使用を推奨しない理由
wwchmtjbwk http://www.g1042ej3gw05dg4g96w9820xrf3lx8sis.org/
<a href="http://www.g1042ej3gw05dg4g96w9820xrf3lx8sis.org/">awwchmtjbwk</a>
[url=http://www.g1042ej3gw05dg4g96w9820xrf3lx8sis.org/]uwwchmtjbwk[/url]
ProteinPilot 検索でTrEMBL FASTA ファイルの使用を推奨しない理由
[url=http://www.gl7wdm406g9z7a8g48xa1dk1d984z7h6s.org/]ubthonzrr[/url]
<a href="http://www.gl7wdm406g9z7a8g48xa1dk1d984z7h6s.org/">abthonzrr</a>
bthonzrr http://www.gl7wdm406g9z7a8g48xa1dk1d984z7h6s.org/
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