遺伝子発現解析

少量の貴重なRNAサンプルで可能な高感度かつ定量的で再現性のあるマルチプレックス遺伝子発現

どのようにしたら1回の反応で最大30遺伝子までを0.5倍という低い遺伝子発現比率で検出できるでしょうか。

例えば、幹細胞多分化能、癌研究、複数の呼吸ウイルスの同定または食品・飲料中の細菌や酵母菌の同定を行っている場合、一度に複数の遺伝子(少ないサンプル数が望ましい)に対する遺伝子発現のわずかな変化をどのように同定するかいう課題に直面します。

GenomeLab遺伝子解析システムを使って高度なマルチプレックス逆転写PCR*アプローチ(XP-PCR*)をご利用いただけますXP-PCRはシングルもしくはマルチプレックスqPCR*アプローチと比較してより高い感度、速度、費用対効果で迅速かつ効率的にマルチプレックスに遺伝子を見ることを可能にします。

GenomeLab GeXP遺伝子解析システムは遺伝子発現比0.5倍という低い変化を正確に検知し、より精度の高い情報を提供します。ユニバーサルプライミングストラテジーにより強化されたXP-PCR*は複数のリファレンス遺伝子、対象遺伝子および内在性コントロールを偏りなく1つのウェルで分析されるようにします。これにより最も正確なノーマライゼーションが可能となり、遺伝子発現の非常にわずかな変化を高い信頼性で検出できるようになります。

GenomeLab GeXP遺伝子解析システムはマルチプレックスパネルバリデーションおよびパスウェイ研究に理想的です。中核となる領域には幹細胞多分化能研究、FFPEサンプルを使用した癌研究、呼吸ウイルス同定のためのマルチプレックス微生物検出、食品・飲料の細菌とイーストの特性評価が含まれます。GeXPはまた初期の発見を終えた研究者を文献や大規模なスクリーニングテクノロジーにより支援します。GeXPシステムは多分化、定量的遺伝子発現解析および多目的の遺伝子解析プラットフォームに使用されます。

遺伝子発現ソリューションの利点

  • ハイスループットな定量的遺伝子発現 - 1反応毎に最大30遺伝子を同時解析できるキャパシティをもつ拡張性の高いGenomeLab™ GeXPは24時間無人で最大5,760データポイントの検査を実現します。
  • 省時間で費用効果の高い遺伝子発現 - マルチプレックスにより、遺伝子発現毎の費用と時間は大幅に削減され、1サンプルあたり最大30遺伝子を分析することが可能です。
  • 信頼できる高い真度と再現性 - 比類ない直線性(ほとんどの遺伝子でR2 > 0.99)をもつGeXPは高精度の遺伝子発現プロファイリングを提供し、最小0.5倍までの遺伝子発現比を検出します。非常に高いS/N比はサンプル全体で感度と再現性を向上させ、より正確で情報量の多い結果につながります。
  • 標的遺伝子の正確な表現 - PCR反応内の増幅された産物が純粋に意図したものとは限りません。代替および偽遺伝子転写産物は相同プライマー配列により増幅が可能です。PCR産物をキャピラリー電気泳動法を使用してサイズ分離することで、非特異的なものから特異的なものを分離同定し、定量できるようになります。これにより特異性のある意図した標的遺伝子高い真度と精度で定量できるようになります。この利点はマルチプレックスな、逆転写PCRアプローチとキャピラリー電気泳動法に特有のもので、GenomeLabTM GeXP遺伝子発現特性解析(XP-PCR)プロセスにより提供されます。マルチプレックス環境における最も真度の高い定量ということになります。
  • 少量のサンプル - マルチプレックス手法をキャピラリー電気泳動法と組み合わせることで、特定の遺伝子のセットをわずか5~50ngのトータルRNAを使用して効率的に見ることができます。
  • 包括的なソフトウェアツール - GenomeLab GeXPは高度な一連のソフトウェアツールを備えており、プライマーの設計からハイスループットの遺伝子発現研究のデータ管理に至るまで支援します。

マルチプレックス遺伝子発現により高い感度、真度、精度を提供。

  • 直線性と精度 - GenomeLab GeXPは高い直線性をもつ遺伝子発現データを生成します。マルチプレックスの各遺伝子に対してRNA量と遺伝子発現レベルの間には平均相関係数(R2)0.99を軽く上回る非常に高い線形相関が認められます。
  • 真度 - GenomeLab GeXPの高い感度により遺伝子発現のたとえわずかな変化も高い精度で検出します。RNA濃度が0.5倍増加するとマルチプレックスアッセイ内のすべての遺伝子に対してGeXPにより一様かつ正確に定量されます。
  • Human Breast Cancer Electropherogram - 乳房の腫瘍の進行に関係する24の機能性遺伝子と3つのリファレンス(ハウスキーピング)遺伝子を同時に分析

幹細胞解析ソリューション - 完全な幹細胞特性評価
幹細胞スクリーニングに関連するワークフローの課題に取り組み、GenomeLab GeXP遺伝子解析システム**は完全なソリューションを一つのシステムで提供します。GeXP StartKitと多分化能パネルを組み合わせることで、コンタミネーション検出のための多能性幹細胞のスクリーニングを促進します。Beckman Coulterの専任技術専門家チームのサポートと合わせ、研究と品質管理プロセスをより効果的かつ効率的にし、時間とお金の節約になります。

Product Features

GenomeLab GeXP Gene Expression Profiling and Fragment Analysis

  • Enhance efficiency with an integrated single-platform solution utilizing the reliability of capillary electrophoresis one array, one gel and one software
  • Examine over 5,700 data points unattended per day with highly accurate relative quantitation of 2-30 genes per reaction
  • Overcome RNA restraints with a requirement of 5 to 50 ng total per reaction
  • Ideal for biomarker signature validation and subsequent screening as well as unique and challenging samples like iPSC colonies, single cell solution and simultaneous detection of multiple transcript variants

Start Kit with Pluripotency Panel

  • Monitor and characterize cell lines at a molecular level with more sensitivity and specificity
  • Compare delivery methods for reprogramming factors
  • Characterize a biomarker signature for each step of somatic cell reprogramming and differentiation of specific lineages
  • Readily identify and assess the pluripotent capacity of individual colonies from non induced lines
  • Monitor pluripotency of stem cell lines
  • Eliminate individual labeling of primers with versatile universal amplification kits

GeXP Human STR Primer Kit

  • Increase confidence in data source by tracking cell lines from the differentiated to pluripotent state and back to differentiated - Monitor and quantify contaminants
  • Utilize 12 loci to identify and track human cell lines from differentiation to iPSC to re-differentiation

Next Generation Pluripotency Biomarker Screening

  • Expedite the process and save time with the only system that offers multiplexing with a universal PCR* primer strategy
  • Save on primer synthesis with the dye-labeled primer incorporated into the GeXP Start Kit
  • Analyze up to 30 genes per reaction with relative quantitation with unrivaled sensitivity and reproducibility

World-Class Customer Service and Support

  • Get technical and applications support on-line, on-site and by phone
  • Receive on-site installation and training for instrument and methods
  • Count on complete post-sales hardware, software and method support

For every researcher there is an ideal analytical technology—one that helps you achieve your goals.

* すべての商標は各所有者の資産です。
** GenomeLab™ GeXP遺伝子解析システムは研究室での使用のみです。研究用にのみ使用できます。GenomeLab™はBeckman Coulter,Inc.の商標です。